En la vuelta de la final de la Liguilla, Independiente, que terminó con dos hombres menos por expulsiones de Méndez y Ortiz, derrotó 2 a 1 a la Academia, que por el triunfo 2-0 en la ida se quedó con el cupo para la Copa del año que viene.
En un Cilindro casi colmado, el uruguayo Cristian Rodríguez puso en ventaja al Rojo con un tiro libre a los 21 minutos del segundo tiempo, cinco después igualó Luciano Lollo con un cabezazo y, cuando a Independiente ya le habían expulsado a dos jugadores, Juan Lucero puso el 2-1 en tiempo adicionado.
Con este resultado, el equipo de Diego Cocca (que dirigió su último partido) resultó vencedor de la Liguilla Pre-Libertadores y consiguió el pasaje para la próxima edición del certamen más importante del continente. Los de Mauricio Pellegrino, en tanto, quedaron clasificados para la Copa Sudamericana.
